Werner Marihart, geboren in Wien, studierte an der Hochschule seiner Heimatstadt Klavier und Dirigieren, bevor er am Badischen Staatstheater Karlsruhe sein erstes Engagement antrat. Zwei Jahre später wechselte er ans Theater der freien Hansestadt Bremen, bevor er 1977 als Erster Kapellmeister an die Städtischen Bühnen Münster kam.

Seit der Zeit unterrichtet er an der Musikhochschule und hat seit 1994 einen weiteren Lehrauftrag an der WWU. Zugleich übernahm er die Leitung des Jungen Sinfonieorchesters.

Als Dirigent gastiert er regelmäßig bei Kulturorchestern, als Pianist tritt er mit Sängern und Kammermusikensembles im In- und Ausland auf.